Workshop organized by Nicolas Loménie, Camille Kurtz and Cécile Badoual (Paris Descartes), with the support of the Paris IAS

Presentation

L’essor de la pathologie digitale est en train de prendre du retard en France alors qu'elle vit une révolution soutenue aux USA, en Chine et au Royaume-Uni. Les anatomo-pathologistes ont un rôle majeur dans cette révolution digitale et s’impliquent de plus en plus. Il devient donc important :

• de commencer à réfléchir sur les moyens de juguler l’absence de stratégie nationale des services d'anatomo-pathologie pour maîtriser ces outils fournis en général par des fournisseurs de solutions logicielles privées généralement peu évolutives/flexibles alors que des besoins communs axés sur des briques de base comme la détection d'éléments clés dans les images de tissu etc. pourraient être mutualisés ;
• de comprendre l’explosion des perspectives d'usage d'IA/machine learning/deep learning/réseaux neuronaux pour devenir acteur de ces changements de métier et préparer la pathologie de demain.
• enfin, l’arrivée des nouveaux moyens de visualisation augmentée doivent être intégrés dans la réflexion globale autour de l’usage des scanners et du multiplexe.

Program

8h45 - 9h15  Accueil Café

9h15 - 9h45  

Equipe Catherine Guettier

Clovis Adam : Quantification automatique des petites fibres nerveuses cutanées pour le diagnostic des neuropathies à petites fibres & Détection automatisée du cancer de la prostate

Olivier Trassard : Quantification automatisée des follicules ovariens

9h45 - 10h15  

Equipe Pierre Brousset

Pierre Brousset : « Etude de la résistance des cancer hématopoiétiques par approche combinée de scRNAseq et imagerie fonctionnelle »

François-Xavier Frénois :  « Un nouveau paradigme pour l’analyse des images de pathologie : Biological Object-Based Image Analysis » 

Pr. Valérie Paradis

10h15 - 10h45  

Equipe Cytomine

Raphael Marée : « Cytomine: technologies web et machine/deep learning pour l'analyse collaborative d'images biomédicales: développements actuels et futurs »

10h45 - 11h15

Christophe Klein : Retour d’expérience plateforme d’imagerie et deep learning

11h15 - 12h00  

Travail de groupe
Présentation solutions existantes sur le marché (libres et commerciales)

12h15 - 14h00

Visite Hôtel de Lauzun et déjeuner sur place

14h00 - 15h00  

Equipe Philippe Bertheau

Philippe Bertheau : Aide au diagnostic avec deep learning pour les pathologies mammaires, collaboration avec Kee-Lab & Mise en place par l'UNESS d'une collection nationale de lames virtuelles multipathologies en ACP, et possibles usages

Maxime Battistella (à confirmer) : Etude des tumeurs cutanées en deep learning, collaboration avec Owkin

Anne Vincent-Salomon, Thomas Walter (Institut Curie)

Marius Ilié et Paul Hofman & Anne Sudaka (Nice)

JC Sabourin (Rouen)

Ghinringhelli François (Dijon)

Equipe Cécile Badoual

Charles Lepine, Marc rassy, Marion Mandavit

15h00 - 15h40  

Equipe IRIMAS/Icube/MHH
Titre : détection, segmentation et classification d’objets d'intérêts dans des WSI

Jonathan Weber

Cédric Wemmert

Robin Heckenauer

15h40 - 16h00

Equipe Séverine Dégano-Valmary

Christine Devalland (pathologiste, hôpital Nord Franche-Comté) & Nourredine Zerhouni (directeur d'équipe, FEMTO-ST institut, rattaché à l'École nationale supérieure de mécanique et des microtechniques de Besançon) : Retour d’expérience de l'IA en cytologie urinaire, dermatopathologie et pathologie mammaire.

Equipe Benoit Terris

Dr Just & Dr Sohier

16h00 - 16h15   Pause café

16h15 - 16h40 (Ouverture)

Ziheng (ANEO) : un exemple de portage industriel

Gilles Le Naour (Hewel) : un exemple de solution de visualisation

16h40 - 18h00 

Toutes les bonnes volontés, élaboration d’un projet commun

WORKSHOP NOT OPEN TO THE PUBLIC